化學起源:生命的原料是怎麼出現的
從原始湯到 RNA 世界,這一頁講生命起源前的化學:胺基酸、核苷酸、自我複製的分子和海底熱泉。
生命的原料,是在 40 億年前到 38 億年前這段時間裡,一步步從化學反應中攢出來的:先有胺基酸,蛋白質的積木出現;再有核苷酸,遺傳字母開始拼寫;接著脂質膜圍出“內”與“外”;然後是 RNA 世界,一種分子既存資訊又能催化;最後分子學會複製自己,膜包住複製系統,形成原細胞。
生命究竟怎樣起源,今天仍是開放的科學問題。下面每一步,都是研究者通過實驗和推理提出的候選解釋,而不是已經完全定論的歷史。
六個步驟
- 胺基酸(米勒-尤里):蛋白質的積木出現。
- 40 億年前 · 核苷酸:遺傳字母開始拼寫。
- 39 億年前 · 脂質膜:油滴圍出“內”與“外”。
- 39 億年前 · RNA 世界:一種分子既存資訊又能催化。
- 38.5 億年前 · 自我複製:分子學會複製自己。
- 38 億年前 · 原細胞:膜包住了複製系統。
可以把這六步想成搭房子:先備好磚(胺基酸),再備好寫字的筆畫(核苷酸),然後圍出牆(脂質膜),再讓屋裡的一種東西既能當說明書又能當工具(RNA),讓它學會影印自己,最後用牆把整套系統圍起來。
原料能不能自己長出來
一個研究生把水、甲烷、氨和氫封進燒瓶,持續放電,竟得到了組成蛋白質的胺基酸(Miller,《Science》1953)。原料也可能來自太空:默奇森隕石裡發現了非地球來源的胺基酸,生命的原料在宇宙中可能很常見(Kvenvolden 等,《Nature》1970)。
核苷酸一度被認為很難在原始條件下做出來。後來有人找到一條更“自然”的化學路線,在原始條件下直接合成 RNA 的元件(Powner、Gerland 與 Sutherland,《Nature》2009)。
RNA 為什麼既是資訊又是工具
RNA 能像酶一樣催化反應,RNA 既是資訊,又是工具,這項發現獲 1989 年諾貝爾獎(Kruger、Cech 等,《Cell》1982)。另一個團隊獨立發現,一種酶真正起催化作用的部分是 RNA 而不是蛋白質(Guerrier-Takada、Altman 等,《Cell》1983)。在這些發現的基礎上,有人提出最早的生命可能完全由 RNA 構成,DNA 和蛋白質都是後來才加入的(Gilbert,《Nature》1986)。
後來的證據繼續補充。核糖體合成蛋白質的核心是 RNA,這是 RNA 世界留下的直接證據,該工作獲 2009 年諾貝爾獎(Nissen 等,《Science》2000)。兩種 RNA 酶互相複製,數量可以持續指數增長,向“分子生命”邁近了一步(Lincoln 與 Joyce,《Science》2009)。
在哪裡發生
深海熱泉周圍存在不依賴陽光的生態系統,生命起源有了一個新的候選地點(Corliss 等,《Science》1979)。這篇論文的題目寫的是加拉帕戈斯裂谷上的海底溫泉。這裡的措辭是“候選”:它提供了一種可能,但不是唯一答案。
想讀原文,可以搜這些題目
- Miller(1953):《A production of amino acids under possible primitive earth conditions》,大意是“在可能的原始地球條件下生成胺基酸”
- Kvenvolden 等(1970):《Evidence for extraterrestrial amino-acids and hydrocarbons in the Murchison meteorite》,大意是“默奇森隕石中存在地外胺基酸和烴類的證據”
- Powner 等(2009):《Synthesis of activated pyrimidine ribonucleotides in prebiotically plausible conditions》,大意是“在前生命時期可信的條件下合成活化的嘧啶核糖核苷酸”
- Kruger、Cech 等(1982):《Self-splicing RNA: autoexcision and autocyclization of the ribosomal RNA intervening sequence of Tetrahymena》,大意是“自我剪接的 RNA:四膜蟲核糖體 RNA 間插序列的自我切除與環化”
- Guerrier-Takada、Altman 等(1983):《The RNA moiety of ribonuclease P is the catalytic subunit of the enzyme》,大意是“核糖核酸酶 P 的 RNA 部分是該酶的催化亞基”
- Gilbert(1986):《Origin of life: The RNA world》,大意是“生命的起源:RNA 世界”
- Nissen 等(2000):《The structural basis of ribosome activity in peptide bond synthesis》,大意是“核糖體在肽鍵合成中活性的結構基礎”
- Lincoln 與 Joyce(2009):《Self-sustained replication of an RNA enzyme》,大意是“一種 RNA 酶的自我維持複製”
- Corliss 等(1979):《Submarine thermal springs on the Galápagos Rift》,大意是“加拉帕戈斯裂谷上的海底溫泉”
遊戲裡怎麼體現
遊戲裡,化學起源時代的資源叫有機分子,生成器依次是熱液噴口、閃電合成、隕石輸送和黏土催化。熱液噴口和隕石輸送,在上面的研究裡都能找到線索;至於現實中哪一種才是主要來源,科學界仍在討論。
真實依據
胺基酸(米勒-尤里):蛋白質的積木出現
核苷酸(40 億年前):遺傳字母開始拼寫
脂質膜(39 億年前):油滴圍出“內”與“外”
RNA 世界(39 億年前):一種分子既存資訊又能催化
自我複製(38.5 億年前):分子學會複製自己
原細胞(38 億年前):膜包住了複製系統
相關研究
這些研究和本頁主題相關,但不是本頁內容的直接證明。
米勒-尤里實驗:一個研究生把水、甲烷、氨和氫封進燒瓶,持續放電,竟得到了組成蛋白質的胺基酸。
出處:Miller, Science 1953, "A production of amino acids under possible primitive earth conditions"
無需酶的核苷酸:找到一條更“自然”的化學路線,在原始條件下直接合成 RNA 的元件。
出處:Powner, Gerland & Sutherland, Nature 2009, "Synthesis of activated pyrimidine ribonucleotides in prebiotically plausible conditions"
會剪下自己的 RNA:切赫發現 RNA 能像酶一樣催化反應。RNA 既是資訊,又是工具,獲 1989 年諾貝爾獎。
出處:Kruger, Cech et al., Cell 1982, "Self-splicing RNA: autoexcision and autocyclization of the ribosomal RNA intervening sequence of Tetrahymena"
核糖核酸酶 P:奧爾特曼獨立發現,一種酶真正起催化作用的部分是 RNA 而不是蛋白質。
出處:Guerrier-Takada, Altman et al., Cell 1983, "The RNA moiety of ribonuclease P is the catalytic subunit of the enzyme"
RNA 世界:吉爾伯特提出,最早的生命可能完全由 RNA 構成,DNA 和蛋白質都是後來才加入的。
出處:Gilbert, Nature 1986, "Origin of life: The RNA world"
自我複製的 RNA:兩種 RNA 酶互相複製,數量可以持續指數增長,向“分子生命”邁近了一步。
出處:Lincoln & Joyce, Science 2009, "Self-sustained replication of an RNA enzyme"
太空中的胺基酸:默奇森隕石裡發現了非地球來源的胺基酸,生命的原料在宇宙中可能很常見。
出處:Kvenvolden et al., Nature 1970, "Evidence for extraterrestrial amino-acids and hydrocarbons in the Murchison meteorite"
核糖體是核酶:核糖體合成蛋白質的核心是 RNA,這是 RNA 世界留下的直接證據,獲 2009 年諾貝爾獎。
出處:Nissen, Hansen, Ban, Moore & Steitz, Science 2000, "The structural basis of ribosome activity in peptide bond synthesis"
海底熱泉:深海熱泉周圍存在不依賴陽光的生態系統,生命起源有了一個新的候選地點。
出處:Corliss et al., Science 1979, "Submarine thermal springs on the Galápagos Rift"
相關開源專案
粒子生命
3362 星
hunar4321/particle-life
幾種顏色的粒子,只按「誰吸引誰、誰排斥誰」一張表運動,就會自己聚成像細胞一樣的結構。去掉介面,程式碼不到一頁。