化学的な起源生命の原料はどう現れたか

原始のスープからRNAワールドまで:生命以前の化学。アミノ酸、ヌクレオチド、自己複製分子、熱水噴出孔を含む。

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生命の材料は、40億年前から38億年前のあいだに、化学反応によって一歩ずつ組み上げられていきました。まず、タンパク質の部品であるアミノ酸が現れます。次にヌクレオチドが現れ、遺伝の文字が綴られ始めます。脂質の膜が「内側」と「外側」を区切ります。続いて、1つの分子が情報を蓄えつつ反応を触媒する RNA ワールドが来ます。最後に分子が自分自身をコピーするようになり、膜がそのコピーの仕組みを包み込んで原始細胞ができます。

生命がどう始まったかは、今も科学の未解決の問いです。以下の各段階は、研究者が実験と推論で提案した説明の候補であり、完全に決着した歴史ではありません。

6つの段階

  • アミノ酸(ミラー–ユーリー):タンパク質の部品が現れる。
  • 40億年前・ヌクレオチド:遺伝の文字が綴られ始める。
  • 39億年前・脂質膜:油の滴が「内側」と「外側」を区切る。
  • 39億年前・RNA ワールド:1つの分子が情報を蓄えつつ、反応を触媒する。
  • 38.5億年前・自己複製:分子が自分自身をコピーするようになる。
  • 38億年前・原始細胞:膜が複製の仕組みを包み込む。

6つの段階は、家を建てることにたとえられます。まずレンガ(アミノ酸)が手に入り、次に書くための筆画(ヌクレオチド)、そして壁(脂質膜)を立てます。そして家の中の1つのものが、説明書と道具を兼ねるようになり(RNA)、自分自身をコピーすることを覚え、最後に壁が仕組み全体を包み込みます。

材料は自然にできるのか

ある大学院生が、水、メタン、アンモニア、水素をフラスコに封入し、電気火花を流し続けました。すると、タンパク質を構成するアミノ酸が得られました(Miller, Science, 1953)。材料は宇宙から来た可能性もあります。マーチソン隕石から地球外起源のアミノ酸が見つかり、生命の部品は宇宙にありふれているのかもしれません(Kvenvolden et al., Nature, 1970)。

ヌクレオチドは、原始的な条件では作るのがとても難しいと考えられていました。のちに、より「自然な」化学経路が見つかり、原始的な条件で RNA の構成要素を直接合成できることがわかりました(Powner, Gerland and Sutherland, Nature, 2009)。

なぜ RNA は情報であり道具でもあるのか

RNA は酵素のように反応を触媒できるため、RNA は情報でもあり道具でもあります。この発見は1989年のノーベル賞を受賞しました(Kruger, Cech et al., Cell, 1982)。別のチームも独自に、酵素のうち実際に触媒を行う部分が、タンパク質ではなく RNA であることを見つけました(Guerrier-Takada, Altman et al., Cell, 1983)。これらの発見を踏まえ、最初期の生命は完全に RNA でできていて、DNA とタンパク質はあとから加わったのではないかと提案されました(Gilbert, Nature, 1986)。

のちの証拠がさらに加わりました。タンパク質をつくるリボソームの中核は RNA で、RNA ワールドの名残を示す直接的な証拠であり、この研究は2009年のノーベル賞を受賞しました(Nissen et al., Science, 2000)。2つの RNA 酵素が互いをコピーし、その数が指数関数的に増え続けたことで、「分子の生命」にまた一歩近づきました(Lincoln and Joyce, Science, 2009)。

どこで起きたか

深海の熱水噴出孔のまわりには、日光に頼らない生態系があり、生命の起源に新しい候補地を与えました(Corliss et al., Science, 1979)。この論文はガラパゴス海嶺の海底温泉についてのものです。ここでの言葉は「候補」です。唯一の答えではなく、1つの可能性を示しています。

原典を読むには? 次のタイトルで検索してください

  • Miller (1953): A production of amino acids under possible primitive earth conditions
  • Kvenvolden et al. (1970): Evidence for extraterrestrial amino-acids and hydrocarbons in the Murchison meteorite
  • Powner et al. (2009): Synthesis of activated pyrimidine ribonucleotides in prebiotically plausible conditions
  • Kruger, Cech et al. (1982): Self-splicing RNA: autoexcision and autocyclization of the ribosomal RNA intervening sequence of Tetrahymena
  • Guerrier-Takada, Altman et al. (1983): The RNA moiety of ribonuclease P is the catalytic subunit of the enzyme
  • Gilbert (1986): Origin of life: The RNA world
  • Nissen et al. (2000): The structural basis of ribosome activity in peptide bond synthesis
  • Lincoln and Joyce (2009): Self-sustained replication of an RNA enzyme
  • Corliss et al. (1979): Submarine thermal springs on the Galápagos Rift

ゲームでの表現

ゲームでは、化学的起源の時代の資源は有機分子で、ジェネレーターは熱水噴出孔、雷による合成、隕石による運搬、粘土による触媒です。熱水噴出孔と隕石による運搬の手がかりは、どちらも上の研究に見つかります。現実にどちらが主な供給源だったかは、科学界でも議論が続いています。

実際の根拠

  • アミノ酸(ミラー・ユーリー):タンパク質の材料が現れる

  • ヌクレオチド(40億年前):遺伝の文字が綴られはじめる

  • 脂質膜(39億年前):油滴が「内」と「外」を区切る

  • RNAワールド(39億年前):1つの分子が情報の保存と反応の触媒を両方こなす

  • 自己複製(38.5億年前):分子が自分をコピーすることを覚える

  • 原始細胞(38億年前):膜が自己複製系を包みこむ

関連する研究

これらの研究はこのトピックに関連しますが、このページの直接の証拠ではありません。

  • ミラー・ユーリーの実験:大学院生が水、メタン、アンモニア、水素をフラスコに封じて放電しつづけたところ、タンパク質を構成するアミノ酸ができた。

    出典:Miller, Science 1953, "A production of amino acids under possible primitive earth conditions"

  • 酵素なしのヌクレオチド:原始的な条件で、RNAの部品を直接つくる、より「自然な」化学的経路が見つかった。

    出典:Powner, Gerland & Sutherland, Nature 2009, "Synthesis of activated pyrimidine ribonucleotides in prebiotically plausible conditions"

  • 自分を切るRNA:チェックは、RNAが酵素のように反応を触媒できることを発見した。RNAは情報であり、道具でもある。1989年ノーベル賞。

    出典:Kruger, Cech et al., Cell 1982, "Self-splicing RNA: autoexcision and autocyclization of the ribosomal RNA intervening sequence of Tetrahymena"

  • リボヌクレアーゼP:アルトマンは独立に、ある酵素で実際に触媒を行う部分がタンパク質ではなくRNAであることを見つけた。

    出典:Guerrier-Takada, Altman et al., Cell 1983, "The RNA moiety of ribonuclease P is the catalytic subunit of the enzyme"

  • RNAワールド:ギルバートは、最初期の生命はすべてRNAでできていて、DNAとタンパク質はあとから加わったのかもしれないと提唱した。

    出典:Gilbert, Nature 1986, "Origin of life: The RNA world"

  • 自己複製するRNA:二つのRNA酵素が互いをコピーし、数は指数関数的に増えつづけられる。「分子の生命」に一歩近づいた。

    出典:Lincoln & Joyce, Science 2009, "Self-sustained replication of an RNA enzyme"

  • 宇宙のアミノ酸:マーチソン隕石から、地球外起源のアミノ酸が見つかった。生命の原料は宇宙にありふれているのかもしれない。

    出典:Kvenvolden et al., Nature 1970, "Evidence for extraterrestrial amino-acids and hydrocarbons in the Murchison meteorite"

  • リボソームはリボザイム:リボソームのタンパク質合成の中心はRNAであり、RNAワールドが残した直接の証拠だ。2009年ノーベル賞。

    出典:Nissen, Hansen, Ban, Moore & Steitz, Science 2000, "The structural basis of ribosome activity in peptide bond synthesis"

  • 深海の熱水:太陽光に頼らない生態系が深海の熱水の周辺に存在し、生命の起源に新しい候補地を与えた。

    出典:Corliss et al., Science 1979, "Submarine thermal springs on the Galápagos Rift"

関連するオープンソースプロジェクト

Particle Life

スター3360個

hunar4321/particle-life

いくつかの色の粒子が、誰が誰を引き、誰が誰をはじくかを示す1枚の表に従って動き、自然に細胞のような構造にまとまる。インターフェースを除けば、コードは1ページに満たない。