生命之树主干：域、界、门

地球生命怎么分类？这一页汇总游戏里生命之树的域、界、门，讲它们的上下级关系。

地球上所有生命都来自同一个祖先，所以可以画成一棵树。树根是“最后共同祖先”，从它分出三大域：细菌域、古菌域和真核域；真核域再分成五个界；每个域或界下面是一批门。这一页讲的是游戏里生命之树的“主干”，也就是最上面的三层：域、界、门，不包括更细的纲、目、科。

生命之树的三域划分，是一次真正的改写。过去人们把生命分成细菌和别的；比较核糖体 RNA 后才发现，“细菌”其实是两类截然不同的生命，古菌从此独立成支（Woese 与 Fox，《PNAS》1977）。随后，生命之树被重新划分为细菌、古菌、真核生物三大域（Woese、Kandler 与 Wheelis，《PNAS》1990）。

树根：最后共同祖先

最后共同祖先（LUCA）是树根。从现代基因反推，它可能生活在高温、缺氧、富含氢的深海热泉附近（Weiss 等，《Nature Microbiology》2016）。树上所有的域，都隶属于它。

三大域

域	拉丁名	下属门的数量
细菌域	Bacteria	九个门
古菌域	Archaea	四个门
真核域	Eukaryota	五个界，各含若干门

细菌域的九个门

细菌域下属的九个门是：蓝细菌门、假单胞菌门（变形菌门）、芽孢杆菌门（厚壁菌门）、放线菌门、拟杆菌门、螺旋体门、异常球菌门、产液菌门和热袍菌门。

古菌域的四个门

甲烷杆菌门（广古菌门）
热变形菌门（泉古菌门）
亚硝化球菌门（奇古菌门）
阿斯加德古菌门

阿斯加德古菌门的位置很有意思。在深海沉积物中找到的洛基古菌，携带许多原以为只有真核生物才有的基因（Spang 等，《Nature》2015）。这提示真核生物与古菌的关系格外近。

真核域的五个界

真核域在游戏里分成五个界，每个界下面各有一批门。

界	下属的门
原生动物界	眼虫门、变形虫门、领鞭毛门
色素界	褐藻门、纤毛门、有孔虫门、定鞭藻门、顶复门、甲藻门
植物界	红藻门、绿藻门、轮藻门、苔藓植物门、蕨类植物门、裸子植物门、被子植物门
真菌界	壶菌门、球囊菌门、子囊菌门、担子菌门
动物界	多孔动物门、刺胞动物门、栉板动物门、扁形动物门、线虫动物门、轮虫动物门、缓步动物门、环节动物门、软体动物门、腕足动物门、节肢动物门、棘皮动物门、脊索动物门

动物界下属的门最多，共十三个。植物界从红藻、绿藻一路排到被子植物，几乎就是一条植物登陆的路线：轮藻门之后才出现苔藓植物门，再到蕨类、裸子植物和被子植物。

数一数这棵树

把三个域的门加起来：细菌域九个，古菌域四个，真核域的五个界合起来共三十三个，总共四十六个门。动物界的十三个门是全树里最多的一个界，色素界六个，植物界七个，真菌界四个，原生动物界三个。这棵树只画到“门”这一层，所以看不到更细的分类。整棵树只有一个根、三个域，从根往上一层层分叉，越往上分得越细。

树上的几个关键事件

内共生：线粒体和叶绿体曾是独立的细菌，被吞下后成了细胞的一部分，这个学说当年被十几家期刊拒稿（马古利斯，署名 Sagan，《Journal of Theoretical Biology》1967）。

想读原文，可以搜这些题目

Woese 与 Fox（1977）：《Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary kingdoms》，大意是“原核生物域的系统发育结构：初级的界”
Woese 等（1990）：《Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya》，大意是“迈向生物的自然系统：古菌域、细菌域和真核域的提议”
Spang 等（2015）：《Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes》，大意是“弥合原核生物与真核生物鸿沟的复杂古菌”
Weiss 等（2016）：《The physiology and habitat of the last universal common ancestor》，大意是“最后共同祖先的生理与栖息地”

真实依据

细菌域（Bacteria）：生命之树上的域，隶属于最后共同祖先。
蓝细菌门（Cyanobacteriota）：生命之树上的门，隶属于细菌域。
假单胞菌门（变形菌门）（Pseudomonadota）：生命之树上的门，隶属于细菌域。
芽孢杆菌门（厚壁菌门）（Bacillota）：生命之树上的门，隶属于细菌域。
放线菌门（Actinomycetota）：生命之树上的门，隶属于细菌域。
拟杆菌门（Bacteroidota）：生命之树上的门，隶属于细菌域。
螺旋体门（Spirochaetota）：生命之树上的门，隶属于细菌域。
异常球菌门（Deinococcota）：生命之树上的门，隶属于细菌域。
产液菌门（Aquificota）：生命之树上的门，隶属于细菌域。
热袍菌门（Thermotogota）：生命之树上的门，隶属于细菌域。
古菌域（Archaea）：生命之树上的域，隶属于最后共同祖先。
甲烷杆菌门（广古菌门）（Methanobacteriota）：生命之树上的门，隶属于古菌域。
热变形菌门（泉古菌门）（Thermoproteota）：生命之树上的门，隶属于古菌域。
亚硝化球菌门（奇古菌门）（Nitrososphaerota）：生命之树上的门，隶属于古菌域。
阿斯加德古菌门（Asgardarchaeota）：生命之树上的门，隶属于古菌域。
真核域（Eukaryota）：生命之树上的域，隶属于最后共同祖先。
原生动物界（Protozoa）：生命之树上的界，隶属于真核域。
眼虫门（Euglenozoa）：生命之树上的门，隶属于原生动物界。
变形虫门（Amoebozoa）：生命之树上的门，隶属于原生动物界。
领鞭毛门（Choanozoa）：生命之树上的门，隶属于原生动物界。
色素界（Chromista）：生命之树上的界，隶属于真核域。
褐藻门（Ochrophyta）：生命之树上的门，隶属于色素界。
纤毛门（Ciliophora）：生命之树上的门，隶属于色素界。
有孔虫门（Foraminifera）：生命之树上的门，隶属于色素界。
定鞭藻门（Haptophyta）：生命之树上的门，隶属于色素界。
顶复门（Apicomplexa）：生命之树上的门，隶属于色素界。
甲藻门（Dinoflagellata）：生命之树上的门，隶属于色素界。
植物界（Plantae）：生命之树上的界，隶属于真核域。
红藻门（Rhodophyta）：生命之树上的门，隶属于植物界。
绿藻门（Chlorophyta）：生命之树上的门，隶属于植物界。
轮藻门（Charophyta）：生命之树上的门，隶属于植物界。
苔藓植物门（Bryophyta）：生命之树上的门，隶属于植物界。
蕨类植物门（Pteridophyta）：生命之树上的门，隶属于植物界。
裸子植物门（Gymnospermae）：生命之树上的门，隶属于植物界。
被子植物门（Angiospermae）：生命之树上的门，隶属于植物界。
真菌界（Fungi）：生命之树上的界，隶属于真核域。
壶菌门（Chytridiomycota）：生命之树上的门，隶属于真菌界。
球囊菌门（Glomeromycota）：生命之树上的门，隶属于真菌界。
子囊菌门（Ascomycota）：生命之树上的门，隶属于真菌界。
担子菌门（Basidiomycota）：生命之树上的门，隶属于真菌界。
动物界（Animalia）：生命之树上的界，隶属于真核域。
多孔动物门（Porifera）：生命之树上的门，隶属于动物界。
刺胞动物门（Cnidaria）：生命之树上的门，隶属于动物界。
栉板动物门（Ctenophora）：生命之树上的门，隶属于动物界。
扁形动物门（Platyhelminthes）：生命之树上的门，隶属于动物界。
线虫动物门（Nematoda）：生命之树上的门，隶属于动物界。
轮虫动物门（Rotifera）：生命之树上的门，隶属于动物界。
缓步动物门（Tardigrada）：生命之树上的门，隶属于动物界。
环节动物门（Annelida）：生命之树上的门，隶属于动物界。
软体动物门（Mollusca）：生命之树上的门，隶属于动物界。
腕足动物门（Brachiopoda）：生命之树上的门，隶属于动物界。
节肢动物门（Arthropoda）：生命之树上的门，隶属于动物界。
棘皮动物门（Echinodermata）：生命之树上的门，隶属于动物界。
脊索动物门（Chordata）：生命之树上的门，隶属于动物界。

生命之树主干：域、界、门

真实依据

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