초기 생명최초의 생물은 어떻게 생겼을까
공통 조상에서 3도메인 계통수까지: 최초의 생명, 산소의 증가, 세포 내 공생, DNA 이중 나선의 발견.
우주 달력에서: 시작: 9월 22일38억 – 7억 년 전전체 달력 보기
지구의 모든 생명은 37억 년 전에 살았던 마지막 공통 조상 LUCA 하나에서 나왔습니다. 생명의 나무는 이후 처음으로 세균과 고세균으로 갈라졌습니다. 30억 년 전 시아노박테리아가 산소를 내놓기 시작했습니다. 24억 년 전 대기에 산소가 생겨 많은 혐기성 생물이 사라졌습니다. 20억 년 전 한 세포가 다른 세포를 소화하지 않고 삼켰고, 미토콘드리아는 여기서 나왔습니다.
이 시대의 시간 범위는 "38억 년 전~7억 년 전"이며, 사건은 가장 오래된 공통 조상에서 전 지구적 빙하기까지 이어집니다.
아홉 개의 사건
- 37억 년 전 · LUCA: 모든 생명의 마지막 공통 조상.
- 35억 년 전 · 세균과 고세균: 생명의 나무가 처음으로 갈라집니다.
- 35억 년 전 · 스트로마톨라이트: 미생물 매트가 화석을 남깁니다.
- 30억 년 전 · 산소 발생 광합성: 시아노박테리아가 산소를 내놓기 시작합니다.
- 24억 년 전 · 산소 대폭증 사건: 대기에 산소가 생겨 많은 혐기성 생물이 사라집니다.
- 20억 년 전 · 미토콘드리아 세포내공생: 한 세포가 다른 세포를 소화하지 않고 삼킵니다.
- 18억 년 전 · 진핵 세포: 세포에 핵이 생깁니다.
- 12억 년 전 · 유성생식: 유전자 재조합이 진화를 빠르게 합니다.
- 7억 년 전 · 눈덩이 지구: 얼음이 지구 거의 전체를 덮습니다.
공통 조상과 생명의 나무
현대 유전자를 거슬러 올라가 보면, 모든 생명의 공통 조상은 뜨겁고 산소가 적으며 수소가 풍부한 심해 열수 분출공 근처에 살았을 수 있습니다(Weiss et al., Nature Microbiology, 2016). 이 연구는 마지막 보편 공통 조상의 생리와 서식지를 다룹니다. 그린란드의 암석에는 37억 년 전의 미생물 구조가 보존되어 있을 수 있지만 이 해석은 아직 논쟁 중이므로, 인용할 때 불확실성을 함께 적어야 합니다(Nutman et al., Nature, 2016). 논문 제목은 생명이 얼마나 빨리 나타났는지를 강조합니다.
분류의 변화는 분자 비교에서 왔습니다. 리보솜 RNA를 비교해 보니 우리가 "세균"이라 부르던 것이 사실은 꽤 다른 두 종류의 생명이었고, 고세균이 별도의 가지로 갈라졌습니다(Woese and Fox, PNAS, 1977). 생명의 나무는 이후 세균, 고세균, 진핵생물의 세 역으로 다시 나뉘었습니다(Woese, Kandler and Wheelis, PNAS, 1990). 심해 퇴적물에서 발견된 로키아르카이오타에는 진핵생물에만 있다고 여겨지던 유전자가 많이 들어 있습니다(Spang et al., Nature, 2015).
산소와 진핵 세포
대기 중 산소는 한꺼번에 나타나지 않았습니다. 후퇴를 겪으며 오랜 기간에 걸쳐 늘었으므로, "산소 대폭증 사건"을 하룻밤 사이의 변화로 읽어서는 안 됩니다(Lyons, Reinhard and Planavsky, Nature, 2014). 미토콘드리아와 엽록체는 한때 독립된 세균이었다가 삼켜져 세포의 일부가 되었습니다. 이 이론은 당시 십여 곳의 학술지에서 거절당했습니다(린 마굴리스, Sagan이라는 이름으로 발표, Journal of Theoretical Biology, 1967).
유성생식과 눈덩이 지구
고대 홍조류 화석은 유성생식과 다세포 생물의 역사가 적어도 10억 년이라는 것을 보여 줍니다(Butterfield, Paleobiology, 2000). 나미비아의 지층은 약 7억 년 전 지구가 거의 전부 얼음으로 덮였을 수 있음을 보여 줍니다(Hoffman et al., Science, 1998).
유전 물질: DNA 이중 나선
한 쪽짜리 논문이 유전 물질 DNA가 이중 나선이며, 염기쌍 결합이 유전 정보가 어떻게 복제되는지를 시사한다고 제안했습니다(Watson and Crick, Nature, 1953).
원문이 궁금하다면? 아래 제목으로 검색하세요
- Weiss et al. (2016): The physiology and habitat of the last universal common ancestor
- Nutman et al. (2016): Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures
- Woese and Fox (1977): Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary kingdoms
- Woese et al. (1990): Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya
- Spang et al. (2015): Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes
- Lyons et al. (2014): The rise of oxygen in Earth's early ocean and atmosphere
- Sagan (1967): On the origin of mitosing cells
- Butterfield (2000): Bangiomorpha pubescens n. gen., n. sp., 유성생식, 다세포성, 진핵생물 적응방산에 관한 논문
- Hoffman et al. (1998): A Neoproterozoic snowball Earth
- Watson and Crick (1953): Molecular structure of nucleic acids: A structure for deoxyribose nucleic acid
게임에서는 어떻게 보여 줄까
게임에서 초기 생명 시대의 자원은 세포이고, 생성기는 원핵생물 분열, 화학합성, 시아노박테리아 광합성, 수평 유전자 전달입니다. 가장 단순한 세포 분열에서 화학 에너지로 사는 것, 빛으로 산소를 만드는 것, 마지막으로 서로 다른 생물 사이를 오가는 유전자까지 이어집니다.
실제 근거
LUCA(37억 년 전): 모든 생명의 마지막 공통 조상
세균과 고세균(35억 년 전): 생명의 나무가 처음으로 갈라진다
스트로마톨라이트(35억 년 전): 미생물 매트가 화석을 남긴다
산소 발생 광합성(30억 년 전): 시아노박테리아가 산소를 내놓기 시작한다
산소 대폭발(24억 년 전): 대기에 산소가 생기고 많은 혐기성 생물이 사라진다
미토콘드리아의 세포 내 공생(20억 년 전): 한 세포가 다른 세포를 소화하지 않고 삼킨다
진핵세포(18억 년 전): 세포에 핵이 생긴다
유성 생식(12억 년 전): 유전자 재조합이 진화를 빠르게 한다
눈덩이 지구(7억 년 전): 빙하가 거의 지구 전체를 덮는다
관련 연구
이 연구들은 이 주제와 관련은 있지만 이 페이지의 직접적인 증거는 아니에요.
세 번째 생명: 리보솜 RNA를 비교해 보니 '세균'이 사실은 매우 다른 두 종류의 생명이었고, 고세균이 독립된 가지가 되었다.
출처:Woese & Fox, PNAS 1977, "Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary kingdoms"
3역 체계: 생명의 나무가 세균, 고세균, 진핵생물의 세 역으로 다시 나뉘었다.
출처:Woese, Kandler & Wheelis, PNAS 1990, "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya"
세포 내 공생설: 마굴리스는 미토콘드리아와 엽록체가 한때 독립된 세균이었다가 삼켜져 세포의 일부가 되었다고 제안했다. 열 곳이 넘는 학술지에서 거절당했다.
출처:Sagan (Margulis), Journal of Theoretical Biology 1967, "On the origin of mitosing cells"
LUCA의 고향: 오늘날의 유전자에서 거슬러 올라가 보면, 모든 생명의 공통 조상은 뜨겁고 산소가 없으며 수소가 풍부한 심해 분출구 근처에 살았을 수 있다.
출처:Weiss et al., Nature Microbiology 2016, "The physiology and habitat of the last universal common ancestor"
눈덩이 지구: 나미비아의 암석층은 약 7억 년 전 지구가 거의 통째로 얼음에 덮였을 수 있음을 보여 준다.
출처:Hoffman et al., Science 1998, "A Neoproterozoic snowball Earth"
산소의 등장: 대기 중 산소는 한꺼번에 생기지 않고, 길고 되풀이되는 과정을 거치며 늘어났다.
출처:Lyons, Reinhard & Planavsky, Nature 2014, "The rise of oxygen in Earth's early ocean and atmosphere"
이중 나선: 한 쪽짜리 논문이 DNA가 이중 나선이라고 제안했고, 염기쌍은 유전 정보가 어떻게 복사되는지를 암시했다.
출처:Watson & Crick, Nature 1953, "Molecular structure of nucleic acids: A structure for deoxyribose nucleic acid"
아스가르드 고세균: 심해 퇴적물에서 발견된 로키아르카이오타는 진핵생물에만 있다고 여겨지던 유전자를 많이 지니고 있다.
출처:Spang et al., Nature 2015, "Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes"
가장 오래된 유성 생식: 고대 홍조류 화석은 유성 생식과 다세포 생물의 역사가 적어도 10억 년이 됨을 보여 준다.
출처:Butterfield, Paleobiology 2000, "Bangiomorpha pubescens n. gen., n. sp.: implications for the evolution of sex, multicellularity, and the Mesoproterozoic/Neoproterozoic radiation of eukaryotes"
37억 년 된 스트로마톨라이트: 그린란드의 암석에는 37억 년 된 미생물 구조가 보존되어 있을 수 있지만, 이 해석은 아직 논쟁 중이다.
출처:Nutman et al., Nature 2016, "Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures"
관련 오픈 소스 프로젝트
Lenia
별 3.88천개
Chakazul/Lenia
생명 게임의 연속 버전. 몇 가지 수학 규칙으로 움직이고 돌고 갈라지는 무늬가 자라며, 현미경 속 작은 생물 같아요. 온라인 버전은 바로 해 볼 수 있어요.
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세포 하나에서 진화시켜 나가는 오픈 소스 게임. 개발 계획은 우주 시대까지 이어져요.
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스스로 복제하는 컴퓨터 프로그램이 그 안에서 변이하고 경쟁하며 진화해요. 2003년 ‘네이처’ 논문이 이것으로 복잡한 기능이 한 단계씩 진화하는 과정을 관찰했어요.