Pohon KehidupanDomain, Kerajaan, dan Filum Dijelaskan
Bagaimana kehidupan di Bumi diklasifikasikan? Halaman ini membahas domain, kerajaan, dan filum pada Pohon Kehidupan dalam game dan bagaimana semuanya bersarang satu sama lain.
Semua kehidupan di Bumi berasal dari satu leluhur, sehingga dapat digambar sebagai pohon. Akarnya adalah leluhur universal terakhir. Darinya muncul tiga domain: Bakteri, Arkea, dan Eukariota. Eukariota terbagi menjadi lima kerajaan, dan setiap domain atau kerajaan memuat sejumlah filum. Halaman ini membahas "batang" Pohon Kehidupan di game, tiga lapisan teratasnya: domain, kerajaan, dan filum. Halaman ini tidak turun ke kelas, bangsa, atau suku.
Pembagian tiga domain adalah penulisan ulang biologi yang sesungguhnya. Dulu orang memilah kehidupan menjadi bakteri dan yang lainnya. Perbandingan RNA ribosom menunjukkan bahwa "bakteri" sebenarnya dua jenis kehidupan yang sangat berbeda, dan arkea menjadi cabangnya sendiri (Woese & Fox, PNAS 1977). Pohon Kehidupan lalu digambar ulang dengan tiga domain: Bakteri, Arkea, dan Eukariota (Woese, Kandler & Wheelis, PNAS 1990).
Akar: leluhur universal terakhir
Leluhur universal terakhir (LUCA) adalah akarnya. Dilacak mundur dari gen modern, ia mungkin hidup di dekat ventilasi laut dalam yang panas, bebas oksigen, dan kaya hidrogen (Weiss et al., Nature Microbiology 2016). Setiap domain di pohon ini berasal darinya.
Tiga domain
| Domain | Nama Latin | Jumlah filum |
|---|---|---|
| Bakteri | Bacteria | Sembilan filum |
| Arkea | Archaea | Empat filum |
| Eukariota | Eukaryota | Lima kerajaan, masing-masing dengan beberapa filum |
Sembilan filum bakteri
Sembilan filum dalam Bakteri adalah: Cyanobacteria, Pseudomonadota (Proteobacteria), Bacillota (Firmicutes), Actinobacteria, Bacteroidetes, Spirochetes, Deinococcota, Aquificota, dan Thermotogota.
Empat filum arkea
- Methanobacteriota (Euryarchaeota)
- Thermoproteota (Crenarchaeota)
- Nitrososphaerota (Thaumarchaeota)
- Arkea Asgard
Arkea Asgard menempati posisi yang menarik. Lokiarchaeum, yang ditemukan di sedimen laut dalam, membawa banyak gen yang dulu dikira hanya milik eukariota (Spang et al., Nature 2015). Itu menunjukkan eukariota adalah kerabat arkea yang luar biasa dekat.
Lima kerajaan eukariota
Dalam game, Eukariota dibagi menjadi lima kerajaan, masing-masing dengan sekumpulan filumnya sendiri.
| Kerajaan | Filum |
|---|---|
| Protozoa | Euglenozoa, Amoebozoa, Choanozoa |
| Chromista | Ochrophyta, Ciliates, Foraminifera, Haptophytes, Apicomplexa, Dinoflagellates |
| Tumbuhan | Alga merah, Alga hijau, Stonewort, Lumut, Paku, Gymnospermae, Angiospermae |
| Jamur | Chytrid, Glomeromycota, Jamur kantong, Jamur gada |
| Hewan | Porifera, Cnidaria, Ctenophora, Cacing pipih, Cacing gilik, Rotifera, Tardigrada, Annelida, Moluska, Brachiopoda, Arthropoda, Echinodermata, Chordata |
Hewan punya filum terbanyak, tiga belas. Baris Tumbuhan, dari alga merah dan hijau sampai angiospermae, nyaris menelusuri rute tumbuhan naik ke daratan: stonewort lebih dulu, lalu lumut, dan sesudahnya paku, gymnospermae, dan angiospermae.
Menghitung pohon
Jumlahkan filum di ketiga domain: sembilan di Bakteri, empat di Arkea, dan tiga puluh tiga di lima kerajaan eukariota, jadi empat puluh enam filum semuanya. Hewan paling banyak (tiga belas), diikuti Tumbuhan (tujuh), Chromista (enam), Jamur (empat), dan Protozoa (tiga). Pohon ini hanya digambar sampai tingkat filum, jadi klasifikasi yang lebih halus tidak muncul. Pohon ini punya satu akar dan tiga domain, dan bercabang makin halus di setiap langkah ke atas.
Satu peristiwa kunci di pohon
- Endosimbiosis: mitokondria dan kloroplas dulunya bakteri yang hidup bebas. Setelah ditelan, mereka menjadi bagian dari sel. Ketika gagasan ini diajukan, lebih dari selusin jurnal menolaknya (Margulis, terbit sebagai Sagan, Journal of Theoretical Biology 1967).
Makalah untuk dicari
- Woese & Fox (1977): "Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary kingdoms"
- Woese et al. (1990): "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya"
- Spang et al. (2015): "Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes"
- Weiss et al. (2016): "The physiology and habitat of the last universal common ancestor"
Dasar nyata
Bacteria: sebuah domain pada pohon kehidupan, turunan dari leluhur bersama terakhir.
Sianobakteri (Cyanobacteriota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Bacteria.
Proteobacteria (Pseudomonadota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Bacteria.
Firmicutes (Bacillota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Bacteria.
Actinobacteria (Actinomycetota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Bacteria.
Bacteroidetes (Bacteroidota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Bacteria.
Spirochaetota (Spirochaetota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Bacteria.
Deinococcota: sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Bacteria.
Aquificota: sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Bacteria.
Thermotogota: sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Bacteria.
Archaea: sebuah domain pada pohon kehidupan, turunan dari leluhur bersama terakhir.
Euryarchaeota (Methanobacteriota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Archaea.
Crenarchaeota (Thermoproteota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Archaea.
Thaumarchaeota (Nitrososphaerota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Archaea.
Asgardarchaeota: sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah domain Archaea.
Eukaryota: sebuah domain pada pohon kehidupan, turunan dari leluhur bersama terakhir.
Protozoa: sebuah kerajaan pada pohon kehidupan, di bawah domain Eukaryota.
Euglenozoa: sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Protozoa.
Amoebozoa: sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Protozoa.
Choanozoa: sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Protozoa.
Chromista: sebuah kerajaan pada pohon kehidupan, di bawah domain Eukaryota.
Ochrophyta: sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Chromista.
Ciliata (Ciliophora): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Chromista.
Foraminifera: sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Chromista.
Haptofita (Haptophyta): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Chromista.
Apicomplexa: sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Chromista.
Dinoflagellata (Dinoflagellata): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Chromista.
Tumbuhan (Plantae): sebuah kerajaan pada pohon kehidupan, di bawah domain Eukaryota.
Alga merah (Rhodophyta): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Plantae.
Alga hijau (Chlorophyta): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Plantae.
Charophyta (Charophyta): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Plantae.
Bryophyta (Bryophyta): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Plantae.
Pteridofita (Pteridophyta): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Plantae.
Gymnospermae (Gymnospermae): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Plantae.
Angiospermae (Angiospermae): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Plantae.
Jamur: sebuah kerajaan pada pohon kehidupan, di bawah domain Eukaryota.
Chytrid (Chytridiomycota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Jamur.
Glomeromycota: sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Jamur.
Jamur kantung (Ascomycota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Jamur.
Jamur gada (Basidiomycota): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Jamur.
Hewan (Animalia): sebuah kerajaan pada pohon kehidupan, di bawah domain Eukaryota.
Spons (Porifera): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Hewan.
Cnidaria (Cnidaria): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Hewan.
Ubur-ubur sisir (Ctenophora): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Hewan.
Cacing pipih (Platyhelminthes): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Hewan.
Cacing gelang (Nematoda): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Hewan.
Rotifera (Rotifera): sebuah filum pada pohon kehidupan, di bawah kerajaan Hewan.
Tardigrada (Tardigrada): sebuah filum pada Pohon Kehidupan, di kerajaan hewan.
Annelida (Annelida): sebuah filum pada Pohon Kehidupan, di kerajaan hewan.
Moluska (Mollusca): sebuah filum pada Pohon Kehidupan, di kerajaan hewan.
Brakiopoda (Brachiopoda): sebuah filum pada Pohon Kehidupan, di kerajaan hewan.
Artropoda (Arthropoda): sebuah filum pada Pohon Kehidupan, di kerajaan hewan.
Echinodermata (Echinodermata): sebuah filum pada Pohon Kehidupan, di kerajaan hewan.
Chordata (Chordata): sebuah filum pada Pohon Kehidupan, di kerajaan hewan.
Riset terkait
Studi-studi ini berkaitan dengan topik ini tetapi bukan bukti langsung untuk halaman ini.
Jenis kehidupan ketiga: Membandingkan RNA ribosom menunjukkan bahwa “bakteri” sebenarnya dua jenis kehidupan yang sangat berbeda, dan arkea menjadi cabang tersendiri.
Sumber: Woese & Fox, PNAS 1977, "Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary kingdoms"
Sistem tiga domain: Pohon kehidupan dibagi ulang menjadi tiga domain: Bakteri, Arkea, dan Eukariota.
Sumber: Woese, Kandler & Wheelis, PNAS 1990, "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya"
Teori endosimbiosis: Margulis mengusulkan bahwa mitokondria dan kloroplas dulunya bakteri mandiri yang ditelan dan menjadi bagian sel. Teori ini ditolak lebih dari selusin jurnal.
Sumber: Sagan (Margulis), Journal of Theoretical Biology 1967, "On the origin of mitosing cells"
Rumah LUCA: Menelusuri mundur dari gen modern, leluhur bersama semua kehidupan mungkin hidup di dekat ventilasi laut dalam yang panas, bebas oksigen, dan kaya hidrogen.
Sumber: Weiss et al., Nature Microbiology 2016, "The physiology and habitat of the last universal common ancestor"
Arkea Asgard: Lokiarchaeota yang ditemukan di sedimen laut dalam membawa banyak gen yang dulu dianggap hanya ada pada eukariota.
Sumber: Spang et al., Nature 2015, "Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes"
Proyek sumber terbuka terkait
OneZoom Tree of Life
113 bintang
OneZoom/OZtree
Menggambar seluruh pohon kehidupan sebagai satu peta yang bisa terus diperbesar, dari akar sampai satu spesies.