Kehidupan awalseperti apa makhluk hidup pertama

Dari leluhur bersama hingga pohon tiga domain: kehidupan pertama, naiknya oksigen, endosimbiosis, dan penemuan heliks ganda DNA.

Di Kalender Kosmik: Mulai 22 Sep3,8 miliar – 700 juta tahun laluLihat kalender lengkap

Semua kehidupan di Bumi berasal dari satu leluhur bersama terakhir, LUCA, yang hidup 3,7 miliar tahun lalu. Pohon kehidupan lalu terbelah untuk pertama kalinya menjadi bakteri dan arkea. 3 miliar tahun lalu sianobakteri mulai melepaskan oksigen. 2,4 miliar tahun lalu atmosfer mengandung oksigen dan banyak organisme anaerob punah. 2 miliar tahun lalu satu sel menelan sel lain tanpa mencernanya, dan mitokondria berasal dari sini.

Rentang waktu era ini adalah "3,8 miliar – 700 juta tahun lalu", dan peristiwanya berjalan dari leluhur bersama paling awal hingga zaman es global.

Sembilan peristiwa

  • 3,7 miliar tahun lalu · LUCA: Leluhur bersama terakhir semua kehidupan.
  • 3,5 miliar tahun lalu · Bakteri dan arkea: Pohon kehidupan terbelah untuk pertama kalinya.
  • 3,5 miliar tahun lalu · Stromatolit: Hamparan mikroba meninggalkan fosil.
  • 3 miliar tahun lalu · Fotosintesis penghasil oksigen: Sianobakteri mulai melepaskan oksigen.
  • 2,4 miliar tahun lalu · Peristiwa Oksigenasi Besar: Atmosfer mengandung oksigen dan banyak organisme anaerob punah.
  • 2 miliar tahun lalu · Endosimbiosis mitokondria: Satu sel menelan sel lain tanpa mencernanya.
  • 1,8 miliar tahun lalu · Sel eukariota: Sel mendapat inti.
  • 1,2 miliar tahun lalu · Reproduksi seksual: Rekombinasi gen mempercepat evolusi.
  • 700 juta tahun lalu · Bumi bola salju: Lapisan es menutupi hampir seluruh globe.

Leluhur bersama dan pohon kehidupan

Menelusuri mundur dari gen modern, leluhur bersama semua kehidupan mungkin hidup di dekat lubang hidrotermal laut dalam yang panas, miskin oksigen, dan kaya hidrogen (Weiss dkk., Nature Microbiology, 2016). Studi ini tentang fisiologi dan habitat leluhur universal bersama terakhir. Batuan di Greenland mungkin mengawetkan struktur mikroba berumur 3,7 miliar tahun, tetapi tafsiran ini masih diperdebatkan, sehingga ketidakpastiannya harus dipertahankan saat mengutipnya (Nutman dkk., Nature, 2016). Judul makalah itu menekankan betapa cepatnya kehidupan muncul.

Perubahan dalam klasifikasi datang dari perbandingan molekuler: membandingkan RNA ribosom menunjukkan bahwa yang kita sebut "bakteri" sebenarnya dua jenis kehidupan yang cukup berbeda, dan arkea menjadi cabang tersendiri (Woese dan Fox, PNAS, 1977). Pohon kehidupan kemudian dibagi ulang menjadi tiga domain: Bakteri, Arkea, dan Eukarya (Woese, Kandler dan Wheelis, PNAS, 1990). Lokiarchaeota, yang ditemukan di sedimen laut dalam, membawa banyak gen yang dulu dikira hanya ada pada eukariota (Spang dkk., Nature, 2015).

Oksigen dan sel eukariota

Oksigen di atmosfer tidak datang sekaligus. Kadarnya naik dalam waktu panjang, dengan kemunduran di sela-selanya, jadi "Peristiwa Oksigenasi Besar" tidak boleh dibaca sebagai perubahan semalam (Lyons, Reinhard dan Planavsky, Nature, 2014). Mitokondria dan kloroplas dulunya bakteri mandiri yang menjadi bagian sel setelah tertelan. Teori ini ditolak lebih dari selusin jurnal pada masanya (Lynn Margulis, terbit atas nama Sagan, Journal of Theoretical Biology, 1967).

Reproduksi seksual dan Bumi bola salju

Fosil ganggang merah purba menunjukkan bahwa reproduksi seksual dan kehidupan multisel punya sejarah sedikitnya 1 miliar tahun (Butterfield, Paleobiology, 2000). Lapisan batuan di Namibia menunjukkan bahwa sekitar 700 juta tahun lalu, Bumi mungkin nyaris seluruhnya tertutup es (Hoffman dkk., Science, 1998).

Materi genetik: heliks ganda DNA

Sebuah makalah satu halaman mengusulkan bahwa materi genetik DNA berbentuk heliks ganda, dan bahwa pasangan basa mengisyaratkan bagaimana informasi genetik disalin (Watson dan Crick, Nature, 1953).

Ingin membaca aslinya? Cari judul-judul ini

  • Weiss dkk. (2016): The physiology and habitat of the last universal common ancestor
  • Nutman dkk. (2016): Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures
  • Woese dan Fox (1977): Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary kingdoms
  • Woese dkk. (1990): Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya
  • Spang dkk. (2015): Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes
  • Lyons dkk. (2014): The rise of oxygen in Earth's early ocean and atmosphere
  • Sagan (1967): On the origin of mitosing cells
  • Butterfield (2000): Bangiomorpha pubescens n. gen., n. sp., makalah tentang reproduksi seksual, multiselularitas, dan radiasi eukariota
  • Hoffman dkk. (1998): A Neoproterozoic snowball Earth
  • Watson dan Crick (1953): Molecular structure of nucleic acids: A structure for deoxyribose nucleic acid

Cara game menampilkannya

Dalam game, era Kehidupan awal punya sumber daya sel, dan generatornya adalah Pembelahan prokariota, Kemosintesis, Fotosintesis sianobakteri, dan Transfer gen horizontal. Semuanya berjalan dari pembelahan sel paling sederhana, ke hidup dari energi kimia, ke memakai cahaya untuk membuat oksigen, dan akhirnya gen yang berpindah antarorganisme berbeda.

Dasar nyata

  • LUCA (3,7 miliar tahun lalu): leluhur bersama terakhir semua kehidupan

  • Bakteri dan arkea (3,5 miliar tahun lalu): pohon kehidupan bercabang untuk pertama kalinya

  • Stromatolit (3,5 miliar tahun lalu): hamparan mikroba meninggalkan fosil

  • Fotosintesis oksigenik (3 miliar tahun lalu): sianobakteri mulai melepaskan oksigen

  • Peristiwa Oksidasi Besar (2,4 miliar tahun lalu): atmosfer mendapat oksigen, dan banyak anaerob punah

  • Endosimbiosis mitokondria (2 miliar tahun lalu): satu sel menelan sel lain tanpa mencernanya

  • Sel eukariotik (1,8 miliar tahun lalu): sel mendapat inti

  • Reproduksi seksual (1,2 miliar tahun lalu): rekombinasi genetik mempercepat evolusi

  • Bumi Bola Salju (700 juta tahun lalu): lapisan es menutupi hampir seluruh bola Bumi

Riset terkait

Studi-studi ini berkaitan dengan topik ini tetapi bukan bukti langsung untuk halaman ini.

  • Jenis kehidupan ketiga: Membandingkan RNA ribosom menunjukkan bahwa “bakteri” sebenarnya dua jenis kehidupan yang sangat berbeda, dan arkea menjadi cabang tersendiri.

    Sumber: Woese & Fox, PNAS 1977, "Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary kingdoms"

  • Sistem tiga domain: Pohon kehidupan dibagi ulang menjadi tiga domain: Bakteri, Arkea, dan Eukariota.

    Sumber: Woese, Kandler & Wheelis, PNAS 1990, "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya"

  • Teori endosimbiosis: Margulis mengusulkan bahwa mitokondria dan kloroplas dulunya bakteri mandiri yang ditelan dan menjadi bagian sel. Teori ini ditolak lebih dari selusin jurnal.

    Sumber: Sagan (Margulis), Journal of Theoretical Biology 1967, "On the origin of mitosing cells"

  • Rumah LUCA: Menelusuri mundur dari gen modern, leluhur bersama semua kehidupan mungkin hidup di dekat ventilasi laut dalam yang panas, bebas oksigen, dan kaya hidrogen.

    Sumber: Weiss et al., Nature Microbiology 2016, "The physiology and habitat of the last universal common ancestor"

  • Bumi Bola Salju: Lapisan batuan di Namibia menunjukkan bahwa sekitar 700 juta tahun lalu Bumi mungkin hampir seluruhnya tertutup es.

    Sumber: Hoffman et al., Science 1998, "A Neoproterozoic snowball Earth"

  • Naiknya oksigen: Oksigen di atmosfer tidak datang sekaligus, melainkan naik lewat proses panjang yang berulang.

    Sumber: Lyons, Reinhard & Planavsky, Nature 2014, "The rise of oxygen in Earth's early ocean and atmosphere"

  • Heliks ganda: Makalah satu halaman mengusulkan bahwa DNA berupa heliks ganda, dan pasangan basa mengisyaratkan bagaimana informasi genetik disalin.

    Sumber: Watson & Crick, Nature 1953, "Molecular structure of nucleic acids: A structure for deoxyribose nucleic acid"

  • Arkea Asgard: Lokiarchaeota yang ditemukan di sedimen laut dalam membawa banyak gen yang dulu dianggap hanya ada pada eukariota.

    Sumber: Spang et al., Nature 2015, "Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes"

  • Reproduksi seksual paling awal: Fosil alga merah purba menunjukkan reproduksi seksual dan kehidupan multisel punya sejarah paling tidak semiliar tahun.

    Sumber: Butterfield, Paleobiology 2000, "Bangiomorpha pubescens n. gen., n. sp.: implications for the evolution of sex, multicellularity, and the Mesoproterozoic/Neoproterozoic radiation of eukaryotes"

  • Stromatolit berusia 3,7 miliar tahun: Batuan di Greenland mungkin menyimpan struktur mikroba berusia 3,7 miliar tahun, meski tafsir ini masih diperdebatkan.

    Sumber: Nutman et al., Nature 2016, "Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures"

Proyek sumber terbuka terkait

Lenia

3,88 rb bintang

Chakazul/Lenia

Versi kontinu dari Game of Life. Beberapa aturan matematika menumbuhkan pola yang bergerak, berbelok, dan membelah, seperti makhluk kecil di bawah mikroskop. Versi online-nya langsung bisa dimainkan.

Thrive

3,75 rb bintang

Revolutionary-Games/Thrive

Game sumber terbuka tempat kamu berevolusi dari satu sel. Rencana pengembangannya berlanjut sampai era antariksa.

Avida digital evolution

669 bintang

devosoft/avida

Program komputer yang menggandakan diri bermutasi, bersaing, dan berevolusi di dalamnya. Makalah Nature tahun 2003 memakainya untuk mengamati bagaimana fungsi kompleks berevolusi selangkah demi selangkah.